追捕偷跑出来的怪兽看,聪明可爱的怪物精灵史酷比又回来了!不过,这回他们却怎么也酷不起来了,甚至他们在星球上的声誉也将受到损坏。原来,顶呱城来了位蒙面恶棍,他用怪物机器把一群神秘怪兽全部释放出来,像翼龙怪、黑刀鬼、刀鬼上尉和万伏电魔等等。大群怪兽的出现令整个城市惶惶不安,接连发生的恐怖袭击使顶呱城陷入了一片恐慌之中。在新闻记者希瑟(艾丽西娅•西尔维斯通饰)和市民的压力下,成立了专门针对这群暴发怪物的调查小组,毫无疑问,又是沙吉(马修•利拉德饰)和史酷比(尼尔•凡宁配音)担当重任了。沙吉和史酷比可不想让人认为他们只会摆酷,为了证明自己天才的侦探能力,他们开始了追查一系列的怪兽线索。所有的线索,都指向一个“老男人”威克斯(彼得•伯耶尔饰),他就是释放怪兽的蒙面恶棍,从前的黑刀鬼。他从监狱里逃了出来,率领着逃出的怪兽,开始了肆无忌惮的报仇……与此同时,“神秘公司”的另外三位成员,也开始了他们的侦探冒险。智多星维尔玛(琳达•伽的里尼饰),也对另一个关键嫌疑犯狠狠地打击,他就是顶呱城犯罪学博物馆馆长帕特里(塞思•格林饰)。男子气概十足的弗雷德(小•弗雷迪•普林兹饰)和对图象敏感的达芙妮(莎拉•米雪儿•吉兰饰),则通过分析蒙面恶棍的外貌,努力揭穿他的真实身份……