东京繁华的大街上，发生了一起持枪抢劫珠宝案。警局中央署刑事课主任浅轮直树赶到现场，见到两名嫌犯逃跑，紧跟在后奋力追赶，慌乱中撞倒一名男子，原来也是前来围捕的警员，名叫新藤亮，两人开始联手追捕嫌犯。追赶中，浅轮终于制住了第一名嫌犯并把他交给新藤亮，此时眼见第二名嫌犯就要逃远，一个带着小孩出来玩的男人巧妙地用路障绳绊倒了嫌犯，浅轮制住嫌犯，此人却神情冷漠地不接受浅轮的感激。

警视总监决定成立一个不受其它机制束缚的特别搜查组，特地请来已辞职的宗方朔太郎担任组长，而且承诺全部成员由宗方挑选。正在家里享受休假日的浅轮，接到上级电话赶到了总监办公室，得知自己要被调到这个新成立的特别组，而当宗方一转身，浅轮吃惊地发现，这个新任的组长竟然就是帮助自己抓住嫌犯的那个男人，正是宗方点名要来了自己。

特搜组的办公室准备到位，宗方让浅轮负责召集人员，浅轮有些茫然。他打电话给正在博物馆的小宫山志保，却被小宫山拒绝，又找到矢泽、青柳等原来一起共事的警员，也都被一一拒绝。正当浅轮失望之际，矢泽终于改变了主意，并且答应帮他一起慢慢说服其它人。

当前仅有浅轮和矢泽两名成员的特搜组接到出警电话，打电话的是另外一名过去的同事村濑，三个重聚在案发现场。初步勘查死者名叫野村美穗，是一名考古研究人员，她死在了考古发掘坑内，身旁发现装有毒药的瓶子，而且只有她一个人走过的脚印，一切看起来好象是自杀。但浅轮却机智地发现，周围并没有服用毒药后挣扎的痕迹。

死者的尸体解剖结果显示系服毒死亡，对这个案子感兴趣的小宫山正好来到解剖室，想起自己曾经见过死者，她要求法医调查死者的以往病例。初步的案情分析在特搜组进行，此时法医的调查结果表明死者已经怀孕，而且生前患有骨关节炎，她走路的姿势与正常人不同，因此死者在死亡前留下的脚印不可能是正常的。案件疑点很明显，浅轮驳回了上峰定为自杀的推断，决定深入调查。

调查中众警员听说死者美穗十分崇拜知名的考古学家井出教授，而且她曾经捏造过绳文时代的考古成果，美穗后来递交了辞职申请，井出教授却不同意。浅轮在美穗家中比对照片时，发现架子上心型的绳文时代陶俑复制品不见了。村濑在听人说有可能掉在地下摔碎时，忽然想起曾经接手井出教授办公室绳文复制品大批摔碎的那件案子，他赶紧截回了那些原本要处理掉的碎片。

碎片整合，心形陶俑果然出现了，这说明井出教授办公室的陶俑是死者美穗家里那一件，与此同时，美穗肚子里的胎儿DNA检验结果也证明了是井出的，浅轮将井出带到了警局。案情告白于天下：已婚的井出与美穗有感情纠葛，两人在争执中美穗晕倒，井出为了掩盖碎掉的心形陶俑遂打碎现场其它陶俑混在一起，让学生毒死美穗伪造自杀现场。

井出用法务大臣的关系威胁浅轮，但浅轮坚持将他逮捕。特搜组首战告捷，此时浅轮原来的同事也一一回归，大家重聚一起，决心让法律的阳光照进黑暗。