在购物广场发生的一连窜事件，结果被证实不过是恐怖分子放出的一个烟雾弹。在千钧一发之际，多亏藤丸及时告诉大家病毒是假，才阻止了一场惨剧的发生。但他们通过这一事件也清楚地认识到，这不过是恐怖分子一系列犯罪的一次预演。真正的悲剧才揭开幕布而已。

藤丸好不容易从困境中脱身，便立刻赶往医院看望妹妹遥。可他赶到医院，却发现，一直给妹妹看病的女医生京子已经被人杀害了。原本躺在她身边的遥更是不知去向。就在藤丸感到惊慌失措的时候。电话响了。是把遥绑走的男子打来的。他威胁藤丸，如果想要救自己的妹妹，就入侵THIRD-i的数据库。按照电话指示终于找到妹妹的藤丸，惊恐地发现遥的身上被人安装了遥控炸弹。别无选择的藤丸最终还是答应了恐怖分子的要求，开始了对THIRD-i数据库的黑客行为。

另一方面，恐怖分子还给THIRD-i本部发去了联络，告诉他们“已经给某位女性送去了真正的病毒”。终于，恐怖分子的的魔手伸向了普通市民。而警方和藤丸所要面对的，还有恐怖分子集团设下的重重陷阱。而藤丸就读学校的生物老师，折原玛雅也逐渐露出了本性。