虽然东条医生为被神龙会的成员用刀刺伤了的直树的哥哥和树作了急救手术，但是情况不乐观，和树进入了严密监视状态，不可以有丝毫的懈怠。此时，研究生广田被什么人在研究所内杀害身亡了。虽然直树非常担心意识还没有恢复的哥哥和树的安危，但是还是拜托伦子照顾哥哥，自己出发去执行任务了。据推测，犯人是用钝器将广田杀害后，连电脑都毁掉了的，这种行为是不是为了消灭被害者的研究内容呢？但是，根据研究室的松江教授的说法，广田并没有在研究什么特别重要的课题。在现场还发现了与广田交往的樱送来的高级料理便当。樱似乎在广田被杀害之前来给他送过便当，但是无论伦太郎和直树怎么问樱都说她没有来过，这让两个都不禁觉得她非常可疑。在技术专家理沙的努力下，被破坏的电脑复原了，从残存的资料来看，广田似乎和量子暗号装置的开发有着关系。量子暗号装置是安全局长吉村率领的富士山之会正在开发的一款反间谍活动的装置。另外，还有传闻说樱是吉村的情妇。根据松江教授曾经将广田的研究成果占为己有这一点来看，松江，樱以及吉村都有杀害广田的动机。此时，因为吸毒而被捕的某个未成年人声称自己杀害了广田。根据枝刑警部长的说法，这样这个案件就解决了，这件案件的调查正式结束。怎么看都觉得吉村控制着宫的父亲安西的行动，因为安西的反对不得不与宫分手的村濑少见的暴跳如雷。伦太郎告诉他可以根据自己的想法行动，于是他不顾刑警部长的命令，私下继续对此案进行着调查。最近发生的几起事件之间到底存在着怎样的联系呢？和树的生命以及兄弟之间的关系又会如何发展呢？